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ChEMBL

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ChEMBL抑是ChEMBLdb是有類藥物特性生物活性分子的化學資料庫。

由英國南劍橋郡辛克斯頓威康信託基因組園區歐洲分子生物學實驗室 EMBL 的歐洲生物信息學研究所 EBI 維護。

該資料庫由一間名為 Inpharmatica Ltd . 的生物技術公司開發,予人叫做是StARlite;後來去予 Galapagos NV 收購。隨後佇 EMBL-EBI 由 John Overington 領導 ChEMBL 化學基因組學小組成立。

範圍佮訪問

ChEMBL 資料庫包含針對藥物靶點的化合物生物活性數據。生物活性 Ki、Kd、IC 五十、EC 五十報告。會當過濾佮分析的數據,以開發化合物篩選庫,用佇藥物發現過程中的先導鑑定。

通過對十二種藥物化學期刊三十四 , 空加篇出版物進行整理,ChEMBL \ _ 二佇二空一空年一月推出,涵蓋六百二十二 , 八百二十四種化合物二七八十萬種天然產物兩百四十萬个生物測定測量值。ChEMBL 著會當用生物活性數據崁範圍已經發展成「公共資料庫有史以來上全面」。 二空一空年十月,ChEMBL \ _ 八發布,涵蓋六百三十六 , 兩百六十九種化合物超過兩百九十七萬擺生物測定測量。

ChEMBL \ _ 十添加了 PubChem 確認性化驗以便整合佮 ChEMBL 包含的數據類型和類別相當的數據。

ChEMBLdb 會過 Web 界面訪問抑是通過文件傳輸協議下載。適合計算機化數據挖出來,並且試圖以便進行比較分析標準化無仝款出版物之間的活動。ChEMBL 閣予人整合著其他大型化學資源,包括講 PubChem、英國皇家化學會曉的 ChemSpider 系統。

相關資源

除了資料庫,ChEMBL 小組猶閣開發用佇數據挖的工具佮資源。包括一个專注於激烈的綜合化學基因組學工作台Kinase SARfari。該系統整合併鏈接序列、結構、化合物、篩選數據。

類似的工作台有GPCR SARfari,專注於 GPCR,ChEMBL-予人忽視的熱帶病ChEMBL-Neglected Tropical DiseasesChEMBL-NTD)是開放獲取的初級篩選佮藥物化學數據存儲庫,針對非洲、亞洲、美洲發展中地區的所在熱帶病。ChEMBL-NTD的主要目的是為存放的數據提供一个會當自由訪問的永久存檔分發中心。

二空一二年七月發佈矣新的 ma-lá-lí-á 數據服務網際網路檔案館的存檔,存檔日期兩千空一十六五五十三十 . 由 Medicines for Malaria Venture 贊助,向全球的研究人員。該服務的數據包括來自 Malaria Box 篩查集的化合物,以及佇咧 ChEMBL-NTD 發現的其他寄付 ma-lá-lí-á 數據。

myChEMBL,ChEMBL 虛擬機佇咧二空一三年十月發布,允准用戶訪問完整、免錢、通好安裝的化學信息學基礎設施。

二空一三年十二月,SureChem 專利信息資料庫業務移交 EMBL-EBI。SureChem 改名SureChEMBL

二空一四年引入著一種用佇咧預測佮較跨物種的這个工具 ADME 目標新的資源 ADME SARfari。

參見

  • ChEMBL : Quick Tour on EBI Train OnLine
  • ChEBI
  • DrugBank

參考

外部鏈接

  • ChEMBLdb
  • Kinase SARfari 網際網路檔案館的存檔,存檔日期兩千空一十六抹五五 .
  • ChEMBL-Neglected Tropical Disease Archive
  • GPCR SARfari
  • The ChEMBL-og Open data and drug discovery blog run by the ChEMBL team .