埃德曼降解法
Edman 降解(埃德曼降解,英語:Edman degradation), 也根據所使用試劑來予人號做「PTC 法」抑是「PTH 法」,是趨勢抑是卵白質中 N-端胺基酸序列分析方法之一。由菲爾 ・ 埃德曼(Pehr Edman)首先創立。
機理
用異硫硫酸苯址(Phenylisothiocyanate , 縮寫:PITC)佮分析有真濟 N-端胺基佇鹼性的條件咧反應,生做苯硫硫(PTC)的衍生物,佇酸性條件之下生做五元環,ma-lá-tsih N-捀予人選擇性地切斷,得著 N-端胺基酸殘基的形影喝酮胺衍生物。紲落用有機溶劑將該衍生物件提煉出來,酸作用下,該衍生物無穩定,會繼續反應,形成一个穩定的苯基乙內硫硫(PTH)衍生物。餘下頦鏈中的柬胺無受影響。通過用 HPLC 抑是電泳法分析生做的苯乙內容硫(PTH-胺基酸), 會使鑑定出是佗一个胺基酸。每反應一擺,結果是著一个去 N-端胺基酸殘基的多瑙,賰的鏈會當進入後一个循環,繼續發生降解。
佇一九六七年就出現矣實現根據這原理設計的自動化儀器。利用自動分析儀進行分析的時陣,會當倚靠地測定鋪船的三十个左右胺基酸殘基序列,上濟會使分析五十配六十个胺基酸殘基。佇上好的條件下,逐个人形成一遍 PTH-胺基酸,效率會當保持佇咧百分之九十九以上。而且這法用量少,一般干焦用十二分一百皮莫耳多鼻就會當測定胺基酸序列。對鋪排的較長的濟,會使先共學校切斷做多數,對遮的小保存進行胺基酸分析,才閣共遮的資訊鬥起來,得著起先學鏈中的胺基酸序列。
限制
因為 Edman 降解是以化學試劑嘿 N-端胺基的這个修飾為基礎的,因此當 N-捀去予其他化學基團所封閉的時陣,就需要先去除遮的基團,然後才會當進行定序。此外,卵白質中有含半胱胺酸殘基時,有時兩个半胱胺酸殘基會發生二硫鍵交聯。這款情形下,需要先用過酸將二硫鍵氧化為著–SO 三 H,然後才會當用 Edman 降解測定序列。
另外咧,因為所有反應攏佇咧封閉抑是體外的環境之下,的確會達到平衡,因此若佇第一个試管內底加入 PITC,伊會和試管內的第一个胺基酸的 N-捀胺基結合,毋過因為平衡原理:PITC + 一段胺基酸序列=PITC-胺基酸 + 減了第一个胺基酸的胺基酸序列,所以佇頭一个試管內底會同時存在無結合 PITC 佮有結合 PITC 的胺基酸序列,這會予阮將第一管有 PITC-胺基酸的物質分離了後,繼續佇第二个試管內底加入 PITC,就是這馬第二个試管內底會有少量 PITC-胺基酸 ( 一 ) 佮多量的 PITC-胺基酸 ( 二 )。這時陣咱會當利用聯用質譜法 ( Tandem mass spectrometry ) 等技術來分析,若分析了後發現量濟者為 PITC-胺基酸 ( 二 ),量少者為著 PITC-胺基酸 ( 一 ),因此阮就解決反應無完全的問題。而另外一个問題嘛隨之衍生,若是阮無停的所在重複此步,得著胺基酸的序列的時陣,一直到約第五十个試管開始,就會發現所以胺基酸的量經過分析了後攏會變甲真濟仝款,按呢咱就無法度會使知影胺基酸的序列。這也就是為啥物咱需要先將一段大於五十个胺基酸的序列用水解決予進行切割,予所有片段的胺基酸序列小於五十,按呢咱才會使得著較準確的胺基酸序列。
參見
- 丹磺氯
- 二 , 四-二硝基氟苯
- Bergmann 降解反應
- 化學反應列表