Ensembl
外觀
Ensembl是一項生物信息學研究計畫,旨咧開發一種會當對真核生物基因組進行自動詮釋(automatic annotation)並且加以維護的軟體。愛計畫由英國維康基金桑格研究院佮歐洲分子生物學實驗室所屬分部歐洲生物信息研究所共同協作運營,這是為著回應人類的基因組計畫欲完而且一九九九年啟動的。佇咧一零年了後,Ensembl 的目標猶原是為遺傳學家,分子生物學家佮其他的研究人員的研究咱家己的物種佮其他的龍骨動物佮模式生物的基因組提供集中的資源。Ensembl 是幾个知名的基因組瀏覽器之一,用佇檢索基因組學信息。
相𫝛的資料庫佮瀏覽器猶閣有美國國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information,簡稱 NCBI)佮加州大學聖克魯茲分校的 UCSC 基因組瀏覽器。
軟體佮數據
愛計畫開放所有源信息,所有由這个計畫所產生的數據佮軟體攏會當免費佮自由的對網路頂懸提著使用。
該計劃所開發並使用的大部份軟體是用 Perl 語言編寫的,並是因為的 BiopPerl 的基礎框殼。其他的基因組計畫亦可輕易使用 Perl 語言的應用程式接口(Application programming interface,API)。 可比講,會使用伊對基因抑是克隆 kha-tá-lok-guh 進行詮釋。
目前已經有物種
軟體使用
參閱
- 美國國家生物技術信息中心(NCBI)
- UCSC 基因組瀏覽器
參考資料
外部連結
- 官方網站
- Vega
- Pre-Ensembl
- Ensembl genomes
- UCSC Genome Browser
- NCBI
- Ensembl : Browsing chordate genomes on EBI Train OnLine