一九九九年日本羽球公開賽，為第十八屆日本羽球公開賽，佇一九九九年四月初六至十一佇日本東京都代代木第二體育館舉行，總鋪金十八萬美金。
本屆賽事五個項目中，有兩个項目衛冕成功，分別是查埔單打的丹麥選手彼得 ・ 蓋德、女子雙打的中國組合葛菲 / 顧俊，其中後者是三連霸。
