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外切體複合物

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外切體複合物(英語:exosome complex,抑是 PM / Scl complex,上下文意思清楚的時陣,會當直接講 exosome), 簡稱外切習慣外切體,是一種卵白質複合物,會當降解各種無仝款的核糖核酸(RNA)。 因為複合物表現為核糖核酸外切抹活性,所以去予人號名做外切體。外切體複合物只存在佇咧真核細胞佮古菌中;細菌中是對應有組成和結構閣較簡單的「降解體」複合物來發揮類似的功能。

外切體的核心是一个由六个亞基組成的環狀結構,外圍的亞基攏結合佇這環狀結構頂懸。佇真核細胞內底,這一核心存在佇細胞質佮細胞核(特別是核仁)等細胞區室內底;佇咧無仝的區室內底,佮之結合的卵白質嘛無仝款,對而且會當調控外切體的活性以特異性地降解特定區室的 RNA 受質。外切體的受質包括信使 RNA(mRNA)、 核糖體 RNA(rRNA)以及多種非編碼 RNA。外切體具有核糖核酸外切抹功能,嘛就意味著伊會當對 RNA 的一端(三'捀)開始降解作用,毋是為著特定的所在開始鉸 RNA。

雖然無已知疾病佮外切體直接相關,但是複合物中的濟个卵白亞基是一寡特定自體免疫性疾病(特別是「硬化性肌炎」(Scleromyositis)) 病人家己抗體的靶標,也是治療癌症的一寡抗代謝化學療法(會當阻斷外切體的活性)的靶標。

發現

第一个外切體的發現是來自對模式的生物激酒酵母的研究:一九九七年外切體頭擺咧激酒酵母中被發現,並且被鑑定做一種核糖核酸鼻。兩年了後,研究者發現外切體也存在佇人體細胞中,實際上就是濟濟年前發現的存在佇咧特定自體免疫性疾病的病人體內的一種予人叫做是「PM / Scl 複合物」的家己抗原,具體見 # 疾病一節。著「PM / Scl 複合物」的純化予得愈來愈濟的人源外切體亞基卵白被發現,到尾仔所有形成這一複合物的組分攏得著鑑定。二空空一年,日日本增長的基因組資料予得對古菌中外切體卵白的預測成做可能;毋過一直到二空空三年,來自古菌的外切體複合物才頭一改被純化出來,對而且確定外切體佇古菌中的存在。

結構

核心卵白

外切體複合物的核心是一个由六个卵白亞基所組成的一个環狀結構,這六个卵白質攏屬於仝一類核糖核酸拍毋見(核糖核酸增加 PH 類似卵白,有含 PH 結構域)。 佇古菌中,這六个卵白亞基實際上為兩種無仝的 PH 類似卵白(分別為 Rrp 四十一和 Rrp 四十二)重複出現三改來。真核生物中的外切體的核心環結構由六種無仝的卵白質構成;佇這六个卵白質中,其中三个佮古菌的 Rrp 四十一卵白相仝,另外三个則佮 Rrp 四十二卵白相仝。

結合佇核心環狀結構頂懸的三个卵白質攏有含 S 一結構域(一款 RNA 結合結構域), 其中兩个卵白質閣有含 KH 結構域(K-homology domain,仝款會當結合 RNA)。 佇真核生物當中,含 S 一結構域的三个卵白質攏各無相仝;啊若佇古菌中,這三个卵白質是相仝的抑是至少其中有兩个是相仝的。

相𫝛的環狀結構嘛存在佇核糖核酸 PH 佮多核酸磷酸化扣(PNPase)中。細菌當中的核糖核酸拍 PH,參與喔 tRNA 的處理,仝款會當形成一个由六个仝款核糖核酸響 PH 卵白組成的六箍環複合物。以多核酸磷酸化扣為例,伊是一種會當降解磷酸化的 RNA 的卵白質,佇細菌佮一寡真核生物的葉綠體佮粒線體內底,伊的結構內底既然有兩个 PH 結構域閣含一个 S 一結構域佮一个 KH 結構域;多核酸磷酸化扣會當形成同源三聚體複合物,其構象佮外切體的環狀結構足相𫝛的。因為佇結構域組成和結構頂懸的相𫝛性,外切體和這兩个複合物被認為講佇咧進化頂懸有聯絡,可能有共同祖先。外切體的核糖核酸拍 PH 類似卵白、核糖核酸增加 PH 閣有多核酸磷酸化抹攏是屬於核糖核酸抹著 PH 蛋白家族,為磷酸解核酸外切爿(使用磷酸鹽作為親核攻擊分子來對 RNA 分子的三'捀去除核准酸)。

外圍卵白

除了九个核心卵白以外,真核生物的外切體內底猶閣往往包含兩个會當佮核心結合的卵白質。其中之一是 Rrp 四十四卵白,一款水解核糖核酸拍,屬於核糖核酸抹 R 水解核酸外切抹著(利用水分子來剪切核鍵)蛋白家族。佇酵母中,Rrp 四十四會使佮「所有」的外切體複合物結合,而且對酵母外切體的活性的發揮起著關鍵作用。價值咧講的是,雖然人體內底嘛存在 Rrp 四十四的同源卵白,毋過目前無證據顯示這項源卵白會當佮人源來切體複合物結合。

第二个捷看著的結合卵白質是 _ Rrp 六 _(酵母中)抑是 _ PM / Scl 建一百 _(人體當中)。 佮 Rrp 四十四相𫝛,這一卵白質嘛是水解核糖核酸外切鱟,毋過伊屬於核糖核酸抹 D 蛋白家族。PM / Scl 學一百卵白佇細胞核中的外切體複合物當中上捷看著,但是嘛會當參與形成細胞質中的外切體複合物。

調節卵白

佇這兩个會當佮核心結合的亞基以外,猶閣有真濟卵白質會當佮外切體複合物佇細胞核內底抑是核外互相作用。遮的較鬆結合的卵白質可能會當調控外切體的活性佮特異性。佇細胞質中,外切體會當佮 AU 富含元素(AU rich element)結合卵白(如 KRSP 和 TTP,𪜶會當促進抑是講阻礙 mRNA 的降解)互相作用;若細胞核中的外切體會當佮控制核糖體 RNA 處理的 RNA 結合卵白(如人體內底的 MPP 六猶閣有人佮酵母中的 Rrp 四十七 / C 一 D)互相結合。

除了單一个卵白質以外,猶閣有一寡卵白質複合物會當佮外切體互相作用。其中一項就是細胞質中的 Ski 複合物,Ski 複合物中包括一个 RNA 笠仔旋(Ski 二)並且參與了 RNA 的降解。佇細胞核中,外切體著 rRNA 佮小核仁 RNA 的降解是咧 TRAMP 複合物(仝時陣有 RNA 笠仔旋和多聚腺酸化活性)的介導下進行的。

功能

催化作用

如前咧講,外切體複合物中的濟个卵白亞基攏有和核糖核酸抹結構域。遮的結構域攏屬於三'鋪五'的核糖核酸外切性地,也就是講有遮的結構域的卵白質(ua-sá-bih)是對 RNA 分子的三'端開始對其進行降解。外切體中有和磷酸解的外切性地(核糖核酸增加 PH 類似卵白), 佇真核生物當中閣有水解型外切性地(核糖核酸增加 R 佮核糖核酸酸 D 結構域卵白)。 磷酸解型四界利用無機磷酸根來剪切磷酸雙址鍵,並且生做二磷酸核核酸;水解型清楚利用水分子來水解磷酸雙址鍵,並且釋放單磷酸核核酸。

佇古菌中,落去外切體複合物中的 Rrp 四十一亞基屬於磷酸解的外切性地。核心環境的三个 Rrp 四十一亞基負責發揮複合物的被解活性。佇真核生物當中,外切體當中的核糖核酸 PH 亞基攏無保留催化活性,所以其實所組成的核心環無影跡活性。佇酵母中,外切體的核糖核酸鴻活性主要是由外周卵白亞基 Rrp 四十四(水解型外切性地)來發揮,但這一特定亞基干焦予人發現存在佇酵母,目前並無佇咧人或者是古菌的外切體複合物中揣著其同源卵白。此外,佇咧人佮酵母中攏有佇咧另外一个會當佮外切體結合的水解型阿啄仔(Rrp 六), 伊是人源外切體中的活性來源,對酵母外切體的活性嘛有貢獻。含 S 一結構域的卵白亞基本被認為也有外切性,但是最近的研究結果對這一看法提出質疑,並認為其作用可能只是結合受質以利於外切體對受質的降解。

受質

外切體參與降解佮處理大量各種無仝的 RNA 受質。佇細胞質中,伊參與 mRNA 分子的更新:畫體複合物會當通過和無義介導的降解抑是無終止降解通路中的卵白質互相作用來降解被標記需要進行降解的 mRNA 分子(包含了錯誤資訊的 mRNA)。 另外咧,mRNA 的正常更新過程嘛需要外切體參與的降解過程。真濟卵白質會當通過結合甲佮外切體複合物結合的 mRNA 的三'捀 AU 富含元素起來使 mRNA 穩定抑是無穩定。佇細胞核中,外切體對濟種小核仔 RNA 頂司的正確處理是必不可少的。核仁是外切體複合物的主要聚集區域。佇核仁當中,外切體參與矣對五分之八 S 核糖體 RNA(外切體的第一个予人發現的功能)和數種小核 RNA 的處理。

雖然大多數的細胞攏有含其他會當降解 RNA 的被,會使對無論是三'抑是五'捀著 RNA 進行降解,毋過外切體複合物對細胞的存活猶原必須無可能。若外切體中的卵白質的表現予人為(譬如講通過 RNA 干擾)降低抑是停止,細胞就會停止生長並且慢慢仔死亡。欸外切體複合物的核心卵白以及兩个主要的結合卵白是細胞中的必要卵白質。細菌內底有外切體複合物,相𫝛的功能是由一个閣較簡單的複合物 ─ ─ 降解體來執行。

病疼

自體免疫

外切體複合物是得著自體免疫性病症頭的人家己抗體的靶標。遮的家己抗體予人發現主要存在去患有 PM / Scl 相疊症候群(一款自體免疫性疾病,同時有硬皮病佮多發性肌炎病徵)的病人體內。自身抗體會使用病人的血清通過濟款的檢驗方法得著檢測。過去上捷用的檢測方法是採取用雙向免疫擴散法(使用牛仔囝胸腺提取物)、 免疫螢光(著 HEp 鋪二細胞)抑是免疫共沉底(來自人體細胞提物件)。 佇免疫共沉底分析中間,用抗外切體為陽性的血清,會當恬靜出一系列無仝的卵白質(即外切體複合物中的逐个卵白亞基), 佇外切體複合物被發現進前,𪜶予人叫做「PM / Scl 複合物」。 用來自病人的血清進行免疫螢光分析,會當看著細胞的核仁被特定染色,表明予家己抗體所是別的抗原可能佇核糖體的合成中發揮重要的作用。最近,重組的外切體卵白已經會當予人合成並用佇咧線免疫分析法(line immunoassay)和瑛聯免疫吸引附法(ELISA)來檢測遮的自身抗體。

佇這寡疾病內底,抗體主要是直接識別外切體複合物中的兩个卵白亞基,_ PM / Scl 建一百 _(核糖核酸增加 D 類似卵白)和 _ PM / Scl 鋪七十五 _(核心環中核糖核酸響 PH 類似卵白之一), 捌別這兩个卵白質的抗體予人發現存在佇近百分之三十患有 PM / Scl 重疊症候群的患者體內。除了這兩个主要的家己抗體的靶卵白外口,其他的外切體亞基佮結合卵白(如 C 一 D)嘛會使予病人體內的家己抗體識別。檢測遮的抗體上靈敏的方法是咧 ELISA 中用一段來自 PM / Scl 糊一百卵白上的鋪段來代替規个 PM / Scl 糊一百卵白做抗原。採用這一方法已經佇咧懸達百分之五十五的 PM / Scl 重疊症候群病人體內發現相應的自身抗體,但是遮的抗體佇其他干焦有𠕇皮病、加發性肌炎抑是皮肌炎的病人體內嘛會當予檢測著。

因為遮的自身抗體主要發現佇具有濟款無仝的自體免疫疾病症頭的病人體內,遮的病人的臨床症頭可能會有誠大的精差。上捷看的症頭是往往是單個自體免疫疾病所具有的典型症頭,如雷諾氏症候群、關節炎、肌炎佮硬皮症。對遮的病人的治療佮對單個自體免疫疾病的治療相𫝛,定定使用包括免疫壓制佮免疫調控藥物。

癌症

目前已經發現外切體的活性會使予抗代謝物類的藥物氟尿抹粉(fluorouracil)所或制,氟尿抹抹尿是治療癌症的化學療法中使用的一種藥物,而且是實體腫瘤治療內底的上成功的藥物之一。佇用氟尿抹抹粉處理過的酵母細胞,核糖體 RNA 的加工出現缺陷,這和外切體予人分子生物學方法抑制後所觀察著的現象一致。核糖體 RNA 無法度正確予加工對細胞來講是致命的,這也就解說矣為啥物氟尿孵石這類藥物的抗代謝影響會當予人用佇刣死癌細胞。

亞基列表

參見

  • 核糖核酸增加
  • 降解體
  • 卵白珍體:細胞中降解卵白質的主要工具,有環狀結構。
  • 剪接體:參與喔 RNA 加工,具有 RNA 結合的環狀結構。

注釋

參考文獻

延伸閱讀

  • Vanacova , Stepanka ; Stefl , Richard . The exosome and RNA quality control in the nucleus . EMBO reports . 二千空七堵七 ,( 七 ) . ISSN  一千四百六十九石兩百二十一 X . PMC  一百九十五空五千九百空二   . PMID  一千七百六十五空三千五百三十八 . doi : 十曉一空三八 / sj . embor . 七百四十五空一千空五(英語).   引文格式的一維護:PMC 格式 ( link )
  • Houseley , Jonathan ; LaCava , John ; Tollervey , David . RNA-quality control by the exosome . Nature Reviews Molecular Cell Biology . 二千空六鼻七 ,( 七 ) [二千空二十二孵八孵二] . ISSN  一千四百七十一孵八十 . doi : 十曉一空三八 / nrm 一千九百六十四 .(原始內容存檔佇兩千空二十二岫六扣十二)(英語).
  • Buttner , Katharina ; Wenig , Katja ; Hopfner , Karl-Peter . The exosome : a macromolecular cage for controlled RNA degradation . Molecular Microbiology . 二千空六鼻九 ,六十一( 六 ) [二千空二十二孵八孵二] . ISSN  九百五十學三百八十二 X . doi : 十席一一一一 / j . 一千三百六十五五鋪兩千九百五十八拜二空空六 . 五千三百三十一 . x .(原始內容存檔佇兩千空二十二抹六鋪七)(英語).
  • Lorentzen , Esben ; Conti , Elena . The Exosome and the Proteasome : Nano-Compartments for Degradation . Cell . 二千空六孵五鋪十九 ,一百二五( 四 ) . ISSN  九十二孵八千六百七十四 . PMID  一千六百七十一撨三千五百五十九 . doi : 十曉一空一六 / j . cell . 二千空六鼻空五 . 二(英語).
  • Pruijn , Ger J . M . Doughnuts dealing with RNA . Nature Structural & Molecular Biology . 二千空五孵七 ,十二( 七 ) [二千空二十二孵八孵二] . ISSN  一千五百四十五鋪九千九百八十五 . doi : 十曉一空三八 / nsmb 七百空五五百六十二 .(原始內容存檔佇兩千空二十二抹六鋪七)(英語).
  • 王樹啟;王金髮。外切休研究誘展。生物化學佮生物理進展 . 兩千空二 ,二十九( 一 ) : 十–十三 .

外部連結

  • (英文)卵白質資料庫內底人源外切寢頭的結構
  • (英文)卵白質資料庫中古菌外切馮體的結構
  • (英文)卵白質資料庫中古菌外切抹粉體佮 RNA 結合的結構
  • (英文)卵白質資料庫中酵母外切抹體亞基 Rrp 六的結構