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盤基網柄菌

出自Taiwan Tongues 台語維基
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盤基網柄菌(_Dictyostelium discoideum_)是一種原生生物,屬於黏菌的一種。不三時用來做科學研究所用的模式生物。這種生物帶有六个染色體,基因組大細約著三十四 Mb,其中大約有八千到一堵个基因。

自然生湠地佮食物

佇野外,盤基網柄菌會使佇塗跤佮澹濕的落葉仔內底揣著。伊的主要食物包括細菌,譬如講佇塗內底發現的大腸桿菌,佮腐爛的有機物。盤基網柄菌的單核變形蟲會食佇咧其自然歇睏地發現的細菌,其中包括溫帶落葉林土壤內底和腐爛的樹葉內底。

性命週期佮繁殖

營養階段

盤基網柄菌的性命週期佇成熟的 Sorocarp(子實體)釋放孢子。佇溫暖濕濕的條件下跤,粘菌阿米巴對孢子中孵出來。佇𪜶的營養階段 ( vegetative stage ),粘菌變形蟲 ( myxamoebae ) 細菌為食,通過有絲分裂進行分裂。細菌分泌葉酸,吸引粘菌變形蟲。做細菌供應盡量,粘菌變形蟲進入聚集的階段 ( aggregation stage )。

聚集階段

佇咧聚集過程當中,枵餓會引起卵白質化合物的產生,比如講糖卵白佮腺酸環化又閣。糖卵白允許細胞間黏,腺酸環化又閣產生環腺翕酸 ( cAMP )。環腺石酸由變形蟲分泌,就共厝邊的細胞吸引著中心位置。當𪜶向信號徙動的時陣,𪜶相碰相挵並通過使用糖卵白黏附分子黏做伙。

徙動的階段

一旦變形蟲形成密密聚集體而且細長的細胞堆趨趨平倒佇塗跤,徙動的階段 ( migration stage ) 就開始矣。變形蟲做一種運動偌細胞體的假ma-lá-lí-á ( ) 做伙做工課,嘛叫做軟蜞仔 ( slug )。軟蜞長約二交四毫米 ( mm ),由多達到一百 , 零个細胞組成,而且會當通過佇軟蜞移動的前部細胞中產生纖維素鞘來移動。當伊向光、熱量佮水氣遮的引誘物干焦向前徙動的時陣,該鞘的一部份會留下一條粘糊糊的痕跡。環腺訂酸佮一種號做分化唌因為的物質,對形成無仝款的細胞類型有幫贊。軟蜞仔分化做前柄細胞 ( prestalk cells ) 佮前孢子細胞 ( prespore cells ),𪜶分別徙到頭前佮後壁爿。一旦軟蜞仔揣著合適的環境,軟蜞的前端形成子實體的莖,後端形成子實體的孢仔。最近才發現的前部樣細胞也散佈佇軟蜞仔的規个後部區域。遮的前部狀細胞形成子實體的上底佮孢子帽。佇咧軟蜞仔安頓到一位了,後爿展開,前端攑懸,形成所謂的「墨西哥帽」,子實體形成期階段 ( culmination stage ) 就開始矣。

子實體形成期階段

前莖細胞佮前孢子細胞佇子實體形成期的階段交換位置,形成熟的子實體。墨西哥帽的前端形成一个纖維素管,允准閣較濟的後壁部細胞對管外向頂頭徙動到頂懸,向前柄細胞向下跤徙振動。這種重排形成子實體的莖,由軟蜞仔前端的細胞組成,軟蜞後端的細胞佇咧頂懸,這馬形成子實體的孢仔。佇這个八到十點鐘過程了的時陣,飽穗的子體完全形成熟矣。這子實體懸一又閣二毫米,這馬會當通過釋放到熟的孢仔重新開始整個循環,這種孢子會變成粘菌變形蟲 ( myxamoebae )。

用作模式生物

因為伊的濟濟基因佮人類基因仝源,但伊的性命週期足簡單的,所以盤基網柄菌通常予人用做模式生物。伊會當佇咧有機體、細胞佮分子水平常觀察著,主要是因為𪜶的細胞類型佮行為數量有限,而且閣生長快速。伊用佇咧研究細胞分化、趨化性佮細胞凋亡,這攏是正常的細胞過程。伊閣用研究發育的其他方面,包括細胞分選、模式形成、吞食作用、運動性佮信號轉導。佇其他模式生物中,遮的過程和發育方面愛爾仔不存在,欲遐歹觀察。盤基網柄菌佮高等後生動物密切相關。伊紮相𫝛的基因佮代謝途徑,建成做基因戳除的良好候選者。

當細胞變甲閣較特化以發育做偌細胞生物的時陣,就會發生細胞分化過程。因為基因表達的調整,有可能會發生大細、形狀、代謝活動佮反應性的變化。佇這个物種內底,細胞多樣性佮分化牽涉著由細胞間互相作用佇通往的莖細胞抑是孢子細胞的途徑中做出的決定。遮的細胞的運命攏著愛看𪜶的環境佮模式形成。所以,有機體是研究細胞分化真好的模型。

趨化性定義為生物體沿化學濃度梯度向望遠離化學刺激的通道。某寡生物體佇咧向營養供應方向移動的時陣會表現出趨化性。佇盤基網柄菌,粘菌變形蟲將信號環腺石頭酸 ( cAMP ) 分泌到細胞外口,吸引其他粘菌變形蟲向源頭搬徙。逐个變形蟲攏向中央變形蟲徙動,中央變形蟲散發出上濟的環腺石酸分泌物。然後所有變形蟲攏表現出環腺翕酸的分泌,並且要求𪜶愛開始聚集。遮的化學物質的排放佮變形蟲運動每六分鐘發生一改。變形蟲向濃度梯度徙動六十秒後停止,一直到後一改分泌物發出。單位細胞的這種行為往往會佇一陣細胞中引起振動,而且無仝環腺翕酸濃度的化學波以螺旋狀傳播通過這陣。

數學生物學家 Thomas Höfer 和 Martin Boerlijst 發現著一套優雅的數學方程,會使閣再現盤基網柄菌的捲螺仔佮流動模式。數學生物學家 Cornelis J . Weijer 已經證明,類似的方程會當模擬伊的運動。這寡模式的方程主要受變形蟲種群密度、環腺酸產生速率、和個體變形蟲對環腺影響酸敏感性的影響。車葉仔形圖樣是因為菌落中心的變形蟲形成的,𪜶咧發出環腺臭酸波時旋轉。

使用環腺增加酸成做趨化劑猶未佇咧任何的其他生物體內底確立。佇咧發育生物學中,這是誠有理解的趨化性示例之一,這對理解人類炎症、關節炎、吼喘、淋巴細胞運輸佮軸突引導非常重要。吞食食作用佇免疫監視佮抗原呈遞,細胞類型確定、細胞分選、和模式形成是胚胎發生(embryogenesis)的基本特徵,會當用遮的生物進行研究。

毋過,請注意,對偌細胞階段的集體細胞搬徙,環腺酸振盪可能毋是必需的。一項研究發現講,環腺石酸介導的信號佇盤基網柄菌的濟細胞階段對傳播波變做穩定狀態。

基因組

盤基網柄菌基因組測序項目由國際合作機構佇二空空五年完成閣發表。這是頭一个予完全測序的自由生活的原生動物基因組。盤基網柄菌是一个三十四-Mb 的單倍體基因組成,其鹼基組成做百分之七十七 [A + T],並包含編碼約十二 , 五百種的卵白質六个染色體。盤基網柄菌基因組的測序是其細胞佮發育生物學提供閣較複雜的研究。

參考文獻

外部連結

  • (英文)Model Organisms for Biomedical Research : _ Dictyostelium discoideum _
  • (英文)_ D . discoideum _ at MetaMicrobe : taxonomy , facts , ontologies , and references