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EF手

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EF 手(英語:EF hand)是一種佇鈣結合卵白內底發現的螺仔旋-環-車旋結構域抑是結構基序。

EF 手包括一个腡係-環-車踅拓結構,就像人類的手頭拇佮指指頭仔,而且 Ca 二 + 字和其配體就位佇咧環內。這一結構上早佇小清卵清中發現,小清卵清含有三个 EF 手結構,佮鈣離子結合顛倒造成的筋肉放鬆有關。

EF 手包含兩个 α 笠仔旋,由一个短的(通常包括十二个胺基酸)環狀區域連接,定用著結合鈣離子。EF 手嘛出現佇鈣調卵白的所有結構域佮筋肉卵白質肌鈣卵白 C 中。

鈣離子結合位點

分類

  • 自從 EF 手結構模體佇咧一九七三年被描繪以來,到今為止家族的卵白質已經擴展到至少六十六个亞家族。EF 手結構基元會當分做Canonical EF-handsPseudo EF-hands兩大類:

亞族

  • EPS 十五 homology ( EH ) domain–_ IPR 兩百六十一 _

人類基因組中,包括有 EF 手的卵白質有:

  • ACTN 一、ACTN 二、ACTN 三、ACTN 四、APBA 二 BP ; AYTL 一 ; AYTL 二
  • C 十四 orf 一百四十三 ; CABP 一 ; CABP 二 ; CABP 三 ; CABP 四 ; CABP 五 ; CABP 七 ; CALB 一 ; CALB 二 ; CALM 二 ; CALM 三 ; CALML 三 ; CALML 四 ; CALML 五 ; CALML 六 ; CALN 一 ; CALU ; CAPN 一 ; CAPN 十一 ; CAPN 二 ; CAPN 三 ; CAPN 九 ; CAPNS 一 ; CAPNS 二 ; CAPS ; CAPS 二 ; CAPSL ; CBARA 一 ; CETN 一 ; CETN 二 ; CETN 三 ; CHP ; CHP 二 ; CIB 一 ; CIB 二 ; CIB 三 ; CIB 四 ; CRNN
  • DGKA ; DGKB ; DGKG ; DST ; DUOX 一 ; DUOX 二
  • EFCAB 一 ; EFCAB 二 ; EFCAB 四 A ; EFCAB 四 B ; EFCAB 六 ; EFCBP 一 ; EFCBP 二 ; EFHA 一 ; EFHA 二 ; EFHB ; EFHC 一 ; EFHD 一 ; EFHD 二 ; EPS 十五 ; EPS 十五 L 一
  • FKBP 十 ; FKBP 十四 ; FKBP 七 ; FKBP 九 ; FKBP 九 L ; FREQ ; FSTL 一 ; FSTL 五
  • GCA ; GPD 二 ; GUCA 一 A ; GUCA 一 B ; GUCA 一 C
  • hippocalcin ; HPCAL 一 ; HPCAL 四 ; HZGJ
  • IFPS ; ITSN 一 ; ITSN 二 ; KCNIP 一 ; KCNIP 二 ; KCNIP 三 ; KCNIP 四 ; KIAA 一千七百九十九
  • LCP 一
  • MACF 一 ; MRLC 二 ; MRLC 三 ; MST 一百三十三 ; MYL 一 ; MYL 二 ; MYL 五 ; MYL 六 B ; MYL 七 ; MYL 九 ; MYLC 二 PL ; MYLPF
  • NCALD ; NIN ; NKD 一 ; NKD 二 ; NLP ; NOX 五 ; NUCB 一 ; NUCB 二
  • OCM
  • PDCD 六 ; PEF 一 ; PKD 二 ; PLCD 一 ; PLCD 四 ; PLCH 一 ; PLCH 二 ; PLS 一 ; PLS 三 ; PP 一千一百八十七 ; PPEF 一 ; PPEF 二 ; PPP 三 R 一 ; PPP 三 R 二 ; PRKCSH ; PVALB
  • RAB 十一 FIP 三 ; RASEF ; RASGRP ; RASGRP 一 ; RASGRP 二 ; RASGRP 三 ; RCN 一 ; RCN 二 ; RCN 三 ; RCV 一 ; RCVRN ; REPS 一 ; RHBDL 三 ; RHOT 一 ; RHOT 二 ; RPTN ; RYR 二 ; RYR 三
  • S 一百 A 一 ; S 一百 A 十一 ; S 一百 A 十二 ; S 一百 A 六 ; S 一百 A 八 ; S 一百 A 九 ; S 一百 B ; S 一百 G ; S 一百 Z ; SCAMC 鋪二 ; SCGN ; SCN 五 A ; SDF 四 ; SLC 二十五 A 十二 ; SLC 二十五 A 十三 ; SLC 二十五 A 二十三 ; SLC 二十五 A 二十四 ; SLC 二十五 A 二十五 ; SPATA 二十一 ; SPTA 一 ; SPTAN 一 ; SRI
  • TBC 一 D 九 ; TBC 一 D 九 B ; TCHH ; TESC ; TNNC 一 ; TNNC 二
  • USP 三十二
  • VSNL 一
  • ZZEF 一

另見

  • 定結構域,另外一種由 α-螺旋組成的鈣結合結構基序。

參考文獻

延伸閱讀

外部連結

  • Nelson M , Chazin W . EF-Hand Calcium-Binding Proteins Data Library . Vanderbilt University . [二千空九孵八岩二十九] .(原始內容存檔佇兩千空九九抹八鋪二十五).
  • Haiech J . EF-hand protein database ( EF-handome ) . European Calcium Society and the Université Libre de Bruxelles . [二千空九孵八岩二十九] .(原始內容存檔佇兩千空九九九分之八學九). upon request to haiech @ pharma . u-strasbg . fr
  • Yang J . Calciomics . Georgia State University . [二千空九孵八岩二十九] .(原始內容存檔佇兩千空九石十二). prediction server for EF-hand calcium binding proteins