KEGG

KEGG（英語：Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因佮基因組百科全書，日本語：京都遺骸子 ゲノム 百科事典）是一套日本佇一九九五年制定的人類基因組計劃，所以是關於基因組、增加途徑佮生物化學物質的在線資料庫。其途徑資料庫PATHWAY內底記錄的是細胞內底的分子相揣的作用網路佮具體生物所特有的變化形式。 但是伊有一个缺點『無法度由網頁介面做進一步的計算，譬如講建立複雜的調控網，抑是去揣出反應之間可能的交互作用』。

介紹

KEGG 資料庫項目由京都大學化學研究所教授金久實在一九九五年佇日本人類基因組計畫頭擺提出。 鑑於電算資源通用輔助基因組序列數據的生物學詮釋，金久實開始研發 KEGG PATHWAY 資料庫。KEGG PATHWAY 資料庫是由一系列經人手畫製來做 KEGG 代謝路徑圖的構成，以代表關於代謝以及其他的細胞佮生物機能的實驗成果。每一張路徑圖俱包括一个分子互動佮反應的網路圖，為著連繫基因組內之基因佮路徑所示過程成的基因產物（以卵白質為主）毋過設。此資料庫衍生 KEGG 路徑作圖的分析步，共基因組內的基因內容佮 KEGG PATHWAY 資料庫對，以調查可能佇基因組內底有相關紀錄的路徑佮其相關功能。

開發者表示，KEGG 是生物系統的「電腦的表達形式」（computer representation）。 KEGG 共生物系統的零件佮線路綜合做一，具體來講，其實整合的是基因佮卵白質的遺傳部件、一般人佮化學反應的化學部件、佮分子互動佮反應網路的線路圖。這个概念 KEGG 的資料庫之下，系統、基因組學、化學、健康資訊的分類落會當實現。

• 系統信息
• PATHWAY—細胞佮生物機能的路徑圖
• MODULE—基因的模組佮功能單位
• BRITE—生物實體的階層分類
• 基因組信息
• GENOME—基因組全體
• GENES—基因組全域的基因佮卵白列表
• ORTHOLOGY—基因組全域的基因直系同源組別
• 化學信息
• COMPOUND , GLYCAN—化合物佮聚糖
• REACTION , RPAIR , RCLASS—化學反應
• ENZYME—號名法
• 健康信息
• DISEASE—人類病症
• DRUG—已經批准藥物
• 環境—生藥佮健康相關的物質

外部連結

• KEGG 主頁
• Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
• MetaBase 的 KEGG 條目