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LTR反轉錄轉座子

出自Taiwan Tongues 台語維基
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LTR 反轉錄轉座子(LTR retrotransposon)是生物基因組中一類編碼區兩爿有長尾溜重複序列(LTR)的反轉錄轉座子,長度介於一百 bp 到五 kb 之間,其實 mRNA 可能予人反轉錄做 DNA 了後才插入去基因組內底,作用機制類似反轉錄病毒(特別是反轉錄病毒目的病毒), 但比反轉錄病毒會當成做病毒粒仔離開細胞,LTR 反轉錄轉座子干焦會當佇原本的細胞中複製增殖。LTR 反轉錄轉座子佇植物基因組中占比真懸,如麥仔基因組有懸到百分之七十五的序列為 LTR 反轉錄轉座子。

LTR 反轉錄轉座仔會當順序列分做 Ty 一-copia 類、Ty 三-gypsy 類佮 BEL-Pao 類,分別佮假病毒科、轉座病毒科和 Belpaoviridae 的反轉錄病毒相仝,前兩項攏存在佇動物、植物、真菌佮其他真核生物基因組內底,後者是干焦看著部份的動物基因組。這類的元件通常有 gag 佮 pol 兩个基因,兩者攏編碼多聚卵白,轉譯了後需要卵白翎進一步切割,gag 編碼的卵白會當佇細胞中形成類病毒粒仔,pol 是編碼卵白杜、反轉錄隱、RNA ua-sá-bih H 佮整合增加,會當有病毒粒中將轉座子的 mRNA 反轉錄。LTR 反轉錄轉座子由宿主細胞的 RNA 聚合孵 Ⅱ 轉錄,產生包括 gag 佮 pol 的 mRNA,有的轉座子的 gag 佮 pol 融合成單一開放閱讀框,有的則佇中央有會當致使核糖體移碼的序列,因為有部份核糖體轉譯了後 gag 的序列了後發生移碼也繼續轉譯 pol 的序列,生成的 gag 卵白數量會加於 pol 卵清,毋過大部份 LTR 反轉錄轉座就因為累積大量變來袂當表現遮的卵白,所以失去轉位能力,通常表現者嘛只有佇咧宿主發育的某一寡階段表現。

LTR 反轉錄轉座子佮龍骨撞粅的內源性反轉錄病毒(ERV)區別是後者有編碼包膜卵白(env)的基因,前者是無,但是文獻但是定定有濫用的狀況,而且濟濟內源性反轉錄病毒擲失矣編碼卵白的序列,有的 LTR 反轉錄轉座子新獲得類似 env 卵白的序列,使兩項精差更加無閒。LTR 反轉錄轉座得著 env 基因了可能轉變做內源性反轉錄病毒,若烏腹肚若的 _ gypsy _ LTR 反轉錄轉座子就加出矣類似 env、編碼膜卵白的基因而且有著其他的細胞的能力,成做反轉錄病毒;反進內源性反轉錄病毒擲失 env 嘛可能轉做 LTR 反轉錄轉座子。LTR 反轉錄轉座子佮內源性反轉錄病毒佇人類細胞當中大部份攏袂活跳表現,但是攏可能影響宿主細胞的基因表現,調控異常的時甚至有可能會激活免疫顛倒造成自體免疫疾病。有的 LTR 反轉錄轉座佮內源性反轉錄病毒融入宿主基因組後漸漸演化出新功能,衍生成做宿主的新基因。

有的 LTR 反轉錄轉座子閣有編碼其他的卵白的開放閱讀框,其實功能猶無清楚;有的 LTR 反轉錄轉座仔是失去了編碼 gag 佮 pol 卵白的開放閱讀框,譬如講植物的微型尾溜重複反轉錄轉座(TRIM), 需要倚靠其他的移動元件編碼的反轉錄抹等等的酵素才有法度複製增殖。

參見

  • DIRS 反轉錄轉座子(酪胺酸重組織反轉錄轉座子): 黏菌基因組的一種反轉錄轉座,袂使用整合增加 cDNA 插入基因組,抑是編碼酪胺酸重組織,以位點特異性重組的方式將 cDNA 插入基因組。
  • 哺乳類顯性 LTR 反轉錄轉座子(Mammalian apparent LTR-Retrotransposons,MaLR): 飼奶類基因組的一種 LTR 反轉錄轉座子,其編碼的序列佮一般 LTR 反轉錄轉座子的 gag 和 pol 無仝。

註跤

參考文獻